Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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