Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC103706.1-201ENST00000561761 679 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AL512631.1-201ENST00000604086 840 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GLI3P10071 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms