Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms