Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms