Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms