Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRP2BPQ9P2M1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRP2BPQ9P2M1 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms