Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CLUHP3-207ENST00000563678 1303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 RNASE11-201ENST00000398008 872 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AL662791.4-201ENST00000445544 317 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 AC239859.4-201ENST00000582255 675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH10Q9P2E7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms