Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMBP-201ENST00000324109 6400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4E3-205ENST00000448225 6209 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PKP1-201ENST00000263946 5447 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TIFAB-201ENST00000537858 5923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms