Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms