Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms