Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 LINC00879-202ENST00000463200 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 E2F6P4-201ENST00000468625 514 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 TCF4-AS1-201ENST00000587660 396 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 ETV7-208ENST00000627426 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 AC006022.1-201ENST00000425261 388 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 LILRB1-AS1-201ENST00000456337 554 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 AC008738.4-201ENST00000590492 700 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 LYNX1-205ENST00000620006 868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STRCQ7RTU9 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 IGLV3-22-201ENST00000390307 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 AL355298.1-201ENST00000425391 180 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 AC073655.1-201ENST00000550111 493 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ACAP1-204ENST00000570504 274 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 APOC1P1-202ENST00000571466 253 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 AC090772.2-201ENST00000578443 564 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 EIF3LP1-201ENST00000554099 1658 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ASS1-201ENST00000352480 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 BCCIP-201ENST00000278100 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 AC005838.1-201ENST00000430712 233 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 TCP10-205ENST00000476779 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 LRRC6-201ENST00000250173 1672 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
STRCQ7RTU9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms