Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CHCHD7-201ENST00000303759 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 POM121L1P-202ENST00000605258 1835 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CELF2-AS1-201ENST00000379256 2468 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms