Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PTCH1Q13635 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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