Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms