Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LMO4P61968 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LMO4P61968 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LMO4P61968 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LMO4P61968 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LMO4P61968 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms