Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 GRM4-202ENST00000374181 7275 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVK-16P61578 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms