Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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