Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms