Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRE11P49959 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRE11P49959 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRE11P49959 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms