Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LMAN1P49257 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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LMAN1P49257 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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LMAN1P49257 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LMAN1P49257 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LMAN1P49257 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMAN1P49257 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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