Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPOP42166 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPOP42166 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPOP42166 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms