Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPB2P35606 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms