Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GBP1P32455 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GBP1P32455 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GBP1P32455 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms