Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YY1P25490 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YY1P25490 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
YY1P25490 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
YY1P25490 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
YY1P25490 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
YY1P25490 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 NTF3-201ENST00000331010 1028 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 LINC00929-202ENST00000556159 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YY1P25490 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 CSMD2-202ENST00000338325 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 TIPRL-201ENST00000367830 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 KCNK16-202ENST00000373229 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 MIR197-201ENST00000384976 75 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 PQLC1P1-201ENST00000434950 429 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 TRIQK-213ENST00000521617 774 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 AP005203.1-202ENST00000584204 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 AL596094.1-201ENST00000608273 276 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YY1P25490 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms