Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms