Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM10L2BP0DMW5 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms