Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms