Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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