Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CECR2Q9BXF3 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms