Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms