Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NPRL3Q12980 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms