Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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