Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms