Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms