Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 NELL2-203ENST00000429094 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms