Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2BFSP57053 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms