Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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AP3M2P53677 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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AP3M2P53677 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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AP3M2P53677 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AP3M2P53677 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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