Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms