Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRMP28827 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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PTPRMP28827 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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PTPRMP28827 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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PTPRMP28827 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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PTPRMP28827 OPN1MW-201ENST00000595290 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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PTPRMP28827 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC073316.2-201ENST00000414126 418 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC138781.1-201ENST00000501322 505 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 HNRNPA1P69-201ENST00000552536 933 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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