Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM21P19474 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms