Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPN2P17655 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms