Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BRAFP15056 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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