Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms