Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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