Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms