Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms