Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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RAB9BQ9NP90 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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RAB9BQ9NP90 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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RAB9BQ9NP90 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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RAB9BQ9NP90 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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RAB9BQ9NP90 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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RAB9BQ9NP90 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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RAB9BQ9NP90 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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RAB9BQ9NP90 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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