Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms