Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DUX4L9Q6RFH8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms