Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STRIP1Q5VSL9 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms